Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncor1Q60974 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ncor1Q60974 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncor1Q60974 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms