Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Meis1Q60954 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms