Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d1Q60949 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d1Q60949 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms