Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vdac1Q60932 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms