Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp1r1bQ60829 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.8 ms