Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NfkbibQ60778 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfkbibQ60778 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfkbibQ60778 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfkbibQ60778 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfkbibQ60778 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfkbibQ60778 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfkbibQ60778 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfkbibQ60778 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms