Protein–RNA interactions for Protein: Q60774

Tmem45a, Transmembrane protein 45A, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem45aQ60774 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem45aQ60774 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem45aQ60774 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem45aQ60774 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms