Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms