Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctf1Q60753 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms