Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tcf4Q60722 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcf4Q60722 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms