Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ItgaeQ60677 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms