Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mybpc2Q5XKE0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Mybpc2Q5XKE0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mybpc2Q5XKE0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms