Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms