Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan4Q5SZT6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zkscan4Q5SZT6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms