Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NacadQ5SWP3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NacadQ5SWP3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NacadQ5SWP3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
NacadQ5SWP3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NacadQ5SWP3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms