Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms