Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms