Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKS2

Smim7, Small integral membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim7Q5RKS2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim7Q5RKS2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms