Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms