Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Trim41Q5NCC3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Trim41Q5NCC3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Trim41Q5NCC3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms