Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CoblQ5NBX1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CoblQ5NBX1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms