Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp28Q5I043 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms