Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp22Q5DU02 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp22Q5DU02 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp22Q5DU02 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms