Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnma5Q5DTT8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnma5Q5DTT8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnma5Q5DTT8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pnma5Q5DTT8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnma5Q5DTT8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma5Q5DTT8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma5Q5DTT8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms