Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpjQ569L8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms