Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Shank3Q4ACU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms