Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec4Q497M3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec4Q497M3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms