Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx25Q3ZT31 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.5 ms