Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmub2Q3V209 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms