Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ulk4Q3V129 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ulk4Q3V129 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms