Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms