Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Garnl3Q3V0G7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Garnl3Q3V0G7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms