Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp48Q3V0C5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
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