Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bbof1Q3V079 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms