Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.7 ms