Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fchsd2Q3USJ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fchsd2Q3USJ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fchsd2Q3USJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fchsd2Q3USJ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms