Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28047Q3US59 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms