Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Znf48Q3US17 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf48Q3US17 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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