Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap2Q3UND0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms