Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cln5Q3UMW8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln5Q3UMW8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms