Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl2Q3UMU9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms