Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12cQ3UMT1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r12cQ3UMT1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms