Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
E330014E10RikQ3UL33 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E330014E10RikQ3UL33 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms