Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc177Q3UHB8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms