Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zyg11bQ3UFS0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zyg11bQ3UFS0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zyg11bQ3UFS0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zyg11bQ3UFS0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zyg11bQ3UFS0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zyg11bQ3UFS0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zyg11bQ3UFS0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms