Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmd8Q3UFK8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd8Q3UFK8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd8Q3UFK8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms