Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms