Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pid1Q3UBG2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pid1Q3UBG2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms