Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip13Q3UA06 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms