Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U595 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U595 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U595 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U595 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U595 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U595 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U595 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U595 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3U595 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q3U595 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3U595 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3U595 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U595 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U595 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U595 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U595 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U595 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U595 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U595 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3U595 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U595 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U595 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U595 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U595 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U595 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U595 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U595 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U595 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3U595 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U595 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U595 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3U595 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3U595 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3U595 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3U595 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U595 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U595 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U595 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U595 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U595 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U595 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U595 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U595 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U595 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U595 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U595 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U595 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U595 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U595 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U595 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U595 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms